ა(ა)იპ საქართველოს საპატრიარქოს ლანჩხუთის წმიდა იოანე ნათლისმცემლის სახელობის სასულიერო გიმნაზია დაარსდა 1996 წელს შემოქმედელი მღვდელმთავრის იოსების ლოცვა-კურთხევით. გიმნაზიის დაარსების ინიციატორი გახლდათ რუსუდან ზენაიშვილი, რომელიც სიცოცხლის ბოლომდე (გარდაიცვალა 2011 წელს) ღირსეულად ემსახურებოდა მომავალი თაობის აღზრდის საქმეს.
ა(ა)იპ საქართველოს საპატრიარქოს ლანჩხუთის წმიდა იოანე ნათლისმცემლის სახელობის სასულიერო გიმნაზიის (შემდგომში სასულიერო გიმნაზია) დანიშნულებაა მისცეს მოსწავლეებს დაწყებითი, საბაზო და საშუალო განათლება.